Điều cần biết
- Tệp FNA là tệp Căn chỉnh trình tự DNA và protein Định dạng FASTA.
- Mở một với Geneious.
- Chuyển đổi sang FASTA và các định dạng tương tự với cùng chương trình đó.
Bài viết này giải thích tệp FNA là gì, cách mở tệp và cách lưu tệp sang định dạng khác như FASTA, GB, VCF, hình ảnh, v.v.
Tệp FNA là gì?
Một tệp có phần mở rộng tệp FNA là tệp Căn chỉnh trình tự DNA và protein Định dạng FASTA lưu trữ thông tin DNA có thể được sử dụng bởi phần mềm sinh học phân tử.
Đặc biệt, các tệpFNA có thể được sử dụng để chỉ chứa thông tin axit nucleic trong khi các định dạng FASTA khác chứa thông tin liên quan đến DNA khác, chẳng hạn như những tệp có FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ Phần mở rộng tệp, NET hoặc AA.
Các định dạng FASTA dựa trên văn bản này ban đầu xuất hiện từ một gói phần mềm có cùng tên, nhưng hiện được sử dụng làm tiêu chuẩn trong các ứng dụng căn chỉnh trình tự DNA và protein.
FNA cũng đề cập đến một số thuật ngữ công nghệ không liên quan gì đến định dạng tệp này, như chấp nhận mạng cuối cùng, cơ sở tăng tên tệp / thuộc tính, kiến trúc mạng Fujitsu và quảng cáo hàng xóm nhanh.
Cách mở tệp FNA
Mở một trong Windows, macOS và Linux với Geneious (miễn phí trong 14 ngày). Để thực hiện việc này, hãy điều hướng đến trình đơn File> Importvà chọn nhập tệp qua trình đơn From Filemón trong menu.
Bạn cũng có thể mở một cái bằng Trình tạo hình ảnh vòng BLAST (BRIG).
Hãy thử Notepad ++ hoặc một trình soạn thảo văn bản khác nếu những ý tưởng đó không thành công. Tệp thực sự có thể dựa trên văn bản và dễ đọc hoặc bạn có thể thấy rằng nó không liên quan gì đến định dạng FASTA, trong trường hợp này, việc mở tệp dưới dạng tài liệu văn bản có thể tiết lộ văn bản xác định những gì được sử dụng để tạo tệp hoặc định dạng tệp.
Cách chuyển đổi tệp FNA
Chúng tôi không thể xác minh điều này vì chúng tôi chưa thử, nhưng bạn có thể sử dụng Geneious để chuyển đổi tệp sang nhiều định dạng khác, như FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV và VCF. Điều này có thể được thực hiện thông qua trình đơn File> Exportcủa chương trình.
Chương trình tương tự đó cũng có thể lưu tệp thành PNG, JPG, EPS hoặc PDF, thông qua File> Save As Image File.
Mặc dù thông thường bạn không thể đổi tên phần mở rộng của tệp thành một thứ khác và mong muốn nó hoạt động theo cách tương tự, bạn có thể đổi tên tệp. FNA thành tệp. FA nếu phần mềm giải trình tự DNA cụ thể của bạn chỉ nhận ra định dạng FA.
Thay vì đổi tên phần mở rộng tệp, bạn sẽ muốn sử dụng trình chuyển đổi tệp miễn phí để chuyển đổi các loại tệp khác. Trong trường hợp với các tệp FNA và FA, điều này xảy ra là một số chương trình sẽ chỉ mở các tệp có phần mở rộng tệp FA, trong trường hợp đó, việc đổi tên nó sẽ hoạt động tốt.
Vẫn không mở được?
Nếu sau khi sử dụng các chương trình ở trên, bạn vẫn không thể mở tệp của mình, bạn có thể thấy rằng phần mở rộng tệp thực sự không đọc. FNA mà thay vào đó là một cái gì đó trông tương tự.
Ví dụ, các tệp FNG (Font Navigator Group) trông rất khủng khiếp giống như chúng nói ". FNA" nhưng nếu bạn nhìn kỹ, chỉ có hai chữ cái đầu tiên là giống nhau. Vì các phần mở rộng tệp khác nhau, đó là dấu hiệu cho thấy chúng có định dạng tệp khác và rất có thể sẽ không hoạt động với các chương trình giống nhau.
Cũng có thể nói như vậy đối với nhiều phần mở rộng tệp khác như FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) và FND (Windows Saved Search).
Ý tưởng ở đây là chỉ cần đảm bảo phần mở rộng tệp đọc. FNA. Nếu có, hãy thử lại để sử dụng các chương trình từ trên để mở hoặc chuyển đổi nó. Nếu bạn có một loại tệp khác, hãy nghiên cứu phần mở rộng của nó để tìm ra ứng dụng nào cần thiết để mở hoặc chuyển đổi tệp đó.
FAQ
Làm cách nào để mở tệp FNA bằng Python?
Đầu tiên, chuyển đổi tệp FNA sang định dạng FASTA bằng ứng dụng của bên thứ ba như Geneious. Sau đó, bạn có thể tải xuống Biopython, một bộ công cụ miễn phí có sẵn để tính toán sinh học cho công việc trong tin sinh học. Cuối cùng, hãy tham khảo Hướng dẫn Biopython và Sách dạy nấu ăn để biết hướng dẫn về cách làm việc với các tệp FASTA.
Làm cách nào để tìm số nhà sản xuất FNA của tôi trên tệp thô Tổ tiên?
Bạn có thể tải xuống hầu hết dữ liệu DNA từ Ancestry.com ở định dạng.txt. Tuy nhiên, chỉ những khách hàng có DNA được phân tích bằng giải trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) mới có tùy chọn tải xuống tệp VCF. Để tải xuống tệp VCF, bạn phải là chủ sở hữu DNA, đã được xét nghiệm DNA bằng công nghệ NGS và có ít nhất 350 MB dung lượng trên thiết bị của bạn.
